Kostrouch lab

# Modelové systémy bezobratlých živočichů

# Editace genomů, molekulární biologie, genomika

# Molekulární patologie

Co nabízíme?

- Detekce a výzkum hormonálně aktivních látek v potravě a v prostředí

- Příprava uměle vytvořených proteinů se speciálními vlastnostmi

- C. elegans – genetika, genomika, editace genomu

Co umíme?

- Modelové systémy bezobratlých živočichů

- Editace genomů, molekulární biologie, genomika

- Evolučně zachovalé mechanismy regulace genové exprese

- Vývoj systémů na produkci uměle vytvořených proteinů

- Bioinformatika a molekulární biologie nádorových onemocnění

- Výzkum hormonálně aktivních látek v potravě a v prostředí

Více o našem týmu:

Laboratoř molekulární patologie se zaměřuje na studium evolučně zachovalých regulačních cest, které určují základní chování buněk v tkáních. Cílem výzkumu je pochopení mechanismů podmiňujících vznik nádorů a chování nádorových buněk.Ve svých projektech používá Dr. Kostrouch materiál z lidských nádorů a nádorových linií, ale i modelové organismy bezobratlých, hlístic, plochých červů a diblastických druhů, především medúz. Na nádor je možno pohlížet jako na tkáň, ve které jde evoluční selekční proces obráceným směrem. V tomto procesu jsou odbourávány regulační úrovně, které byly vyvinuty mnohobuněčnými organismy k nastolení buněčné kooperace a specializace. Poznání porušených regulačních cest může v budoucnu pomoci k rozšíření diagnostiky a terapie.

Výzkum dr. Kostroucha sleduje také regulaci genové exprese jadernými receptory některých hormonů (steroidní hormony, hormon štítné žlázy a retinoidy). Jako hormony však působí také další látky, např. cholesterol a další steroly a z nich odvozené molekuly, tuky a jejich metabolity, ale i cizorodé látky vyskytující se v prostředí. Tyto látky mohou jednak ovlivňovat normální regulaci jadernými receptory, zároveň však mohou být také použity k jejich cílenému ovlivnění v průběhu nemoci. Ukazuje se, že základní mechanismy regulace jadernými receptory zahrnují evolučně konzervovanou proteinovou strukturu receptorů, vzájemné proteinové interakce a regulační místa v genech, které jsou jimi regulované.

Cílem výzkumu laboratoře dr. Kostroucha je poznat mechanismy, kterými jaderné receptory regulují diferenciaci buněčných typů, obměnu a regeneraci tkání, a které mění základní funkce jaderných receptorů z funkcí aktivačních na inhibiční.

Nejvýznamnější recentní výsledky:

- Mikoláš P, Kollárová J, Sebková K, Saudek V, Yilma P, Kostrouchová M, Krause MW, Kostrouch Z, Kostrouchová M.: GEI-8, a Homologue of Vertebrate Nuclear Receptor Corepressor NCoR/SMRT, Regulates Gonad Development and Neuronal Functions in Caenorhabditis elegans. PLoS One. 2013;8(3):e58462. doi: 10.1371/journal.pone.0058462

- Kouns NA, Nakielna J, Behensky F, Krause MW, Kostrouch Z, Kostrouchova M.: NHR-23 dependent collagen and hedgehog-related genes required for molting. Biochem Biophys Res Commun. 2011 Oct 7;413(4):515-20. doi: 10.1016/j.bbrc.2011.08.124

- Raska, O., Kostrouchova, V., Behensky, F., Yilma, P., Saudek, V., Kostrouch, Z. and Kostrouchova, M.: SMED-TLX-1 (NR2E1) Is Critical for Tissue and Body Plan Maintenance in Schmidtea mediterranea in Fasting/Feeding Cycles. Folia Biol 2011, 57, 223-231

- Carosa, E., Di Sante, S., Rossi, S., Castri, A., D’Adamo, F., Gravina, G.L., Ronchi, P., Kostrouch, Z., Dolci, S., Lenzi, A. and Jannini, E.A.: Ontogenetic profile of the expression of thyroid hormone receptors in rat and human corpora cavernosa of the penis. J Sex Med 2010, 7, 1381-1390

- Vohanka J, Simecková K, Machalová E, Behenský F, Krause MW, Kostrouch Z, Kostrouchová M.: Diversification of fasting regulated transcription in a cluster of duplicated nuclear hormone receptors in C. elegans. Gene Expr Patterns. 2010 Sep;10(6):227-36. doi: 10.1016/j.gep.2010.05.001