Laboratoř farmakogenomiky ****************************************************************************************** * ****************************************************************************************** ****************************************************************************************** * Co nabízíme ****************************************************************************************** - Výzkum v oblasti farmakogenetiky a genomiky pro kliniky i akademiky - Izolace nukleových kyselin z různých typů buněk a tkání, zejména klinického charakteru - Detekce jednonukleotidových polymorfismů a mutací metodami alelické diskriminace, HRM a - Kvantitativní PCR v reálném čase (qPCR) design a provedení metody pro sledování genové e - Spolupráce při interpretaci výsledků v oblasti metabolismu a transportu cytostatik ****************************************************************************************** * Odborné zaměření ****************************************************************************************** - Laboratoř farmakogenomiky se zabývá zejména hledáním vhodných prognostických a prediktiv pro hodnocení přežívání a odpovědi nádorových pacientů na terapii - Ve vlastním výzkumu využíváme genomické, epigenomické, proteomické a metabolomické příst biomarkerů v tkáňových preparátech pacientů dodaných klinickými pracovišti z celé republik - Hlavní využití prediktivních biomarkerů vidíme v oblasti stratifikace pacientů do jednot režimů - Nalezení a validace prognostických biomarkerů rovněž může přispět k vývoji terapeutik pr - Naše excelence spočívá ve více než dvacetileté zkušenosti v této oblasti podložené řadou projektů včetně Centra excellence GAČR, v publikovaných odborných pracech a v široké mezin spolupráci. ****************************************************************************************** * Členové týmu ****************************************************************************************** - doc. RNDr. Pavel Souček, CSc. – vedoucí laboratoře - Mgr. Veronika Brynychová, Ph.D. - RNDr. Pavel Dvořák, Ph.D. - Ing. Marie Ehrlichová - Mgr. Kateřina Elsnerová - Mgr. Viktor Hlaváč, Ph.D. - Ing. Simona Šůsová - RNDr. Mgr. Radka Václavíková, Ph.D. ****************************************************************************************** * Vybrané publikace ****************************************************************************************** - Hubackova M, Vaclavikova R, Ehrlichova M, Mrhalova, Kodet R, Kubackova K, Vrána D, Gut I Association of superoxide dismutases and NAD(P)H oxidoreductases with prognosis of patient carcinomas. Int J Cancer 2012; 130: 338–348. - Hlavata I, Mohelnikova-Duchonova B, Vaclavikova R, Liska V, Pitule P, Novak P, Bruha J, Holubec L, Treska V, Vodicka, P, Soucek P. The role of ABC transporters in progression and of colorectal cancer. Mutagenesis 2012; 27: 187–96. - Vaclavikova R, Ehrlichova M, Hlavata I, Pecha V, Kozevnikovova R, Trnkova M, Adámek J, E Kristensen VN, Gut I and Soucek P. Detection of frequent ABCB1 polymorphisms by high-resol curve analysis and their effect on breast carcinoma prognosis. Clin Chem Lab Med 2012; 50: - Brynychová V, Hlaváč V, Ehrlichová M, Václavíková R, Pecha V, Trnková M, Wald M, Mrhalov K, Pikus T, Kodet R, Kovář J, Souček P. Importance of transcript levels of caspase-2 isofo breast carcinoma progression. Future Oncol 2013; 9: 427–38. - Hlaváč V, Brynychová V, Václavíková R, Ehrlichová M, Vrána D, Pecha V, Koževnikovová R, J, Kopperová D, Gut I, Souček P. The expression profile of ABC transporter genes in breast Pharmacogenomics 2013; 14: 515–29. - Mohelnikova-Duchonova B, Brynychova V, Oliverius M, Honsova E, Kala Z, Muckova K, Soucek in transcript levels of ABC transporters between pancreatic adenocarcinoma and non-neoplas Pancreas 2013; 42: 707–16. - Ehrlichova M, Mohelnikova-Duchonova B, Hrdy J, Brynychova V, Mrhalova M, Kodet R, Rob L, Soucek P, Vaclavikova R. The association of taxane resistance genes with the clinical cour carcinoma. Genomics. 2013; 102: 96–101. - Mohelnikova-Duchonova B, Brynychova V, Hlavac V, Kocik M, Oliverius M, Hlavsa J, Honsova Kala Z, Melichar B, Soucek P. The association between the expression of solute carrier tra prognosis of pancreatic cancer. Cancer Chemother Pharmacol. 2013; 72: 669–82. - Kunická T, Souček P. Importance of ABCC1 for cancer therapy and prognosis. Drug Metab Re 342. - Kunická T, Václavíková R, Hlaváč V, Vrána D, Pecha V, Rauš K, Trnková M, Kubáčková K, Am L, Vodička P, Souček P. Non-coding polymorphisms in nucleotide binding domain 1 in ABCC1 g with transcript level and survival of patients with breast cancer. Plos One 2014; 9: e1017 - Hlaváč V, Brynychová V, Václavíková R, Ehrlichová M, Vrána D, Pecha V, Trnková M, Kodet Kubáčková K, Gatěk J, Vážan P, Souček P. The role of cytochromes P450 and aldo-keto reduct of breast carcinoma patients. Medicine 2014; 93 (28): e2552014. ****************************************************************************************** * Zajímá vás tato expertíza? ****************************************************************************************** Kontaktujte CPPT UK Web: www.cppt.cuni.cz/ [ URL "https://cppt.cuni.cz/"] Mail: transfer@cuni.cz Tel.: +420 224 491 255 *========================================================================================= * Naši experti a jejich pracoviště *========================================================================================= doc. RNDr. Pavel Souček, Ph.D. CSc. Biomedicínské centrum Web: www.biomedic-plzen.cz [ URL "http://www.biomedic-plzen.cz"]