Laboratoř molekulární patologie ****************************************************************************************** * ****************************************************************************************** # Molekulární biologie # Patologie # Lymfomy # Nádory měkkých tkání, nádory CNS # Karcinomy # Somatické mutace # Minimální reziduální/diseminovaná nemoc # Cirkulující nádorová DNA, cirkulující nádorové buňky, tekutá biopsie ****************************************************************************************** * Co nabízíme ****************************************************************************************** - Komplexní pohled na posouzení tkání a buněk s následnou analýzou nukleových kyselin s ap molekulárních metod (PCR, RQ-PCR, sekvenování), mikrodisekci z tkání - Diagnostiku nádorových onemocnění, aplikovaný výzkum a vzdělávání a konzultaci v molekul nádorů - Diagnostiku lymfomů a sledování minimální zbytkové nemoci - Diagnostiku nádorů měkkých tkání, zejména sarkomů a sledování minimální diseminované nem - Diagnostiku nádorů centrálního nervového systému - Prediktivní testování karcinomů (plic, ovárií, kolorektální karcinomy), melanomů, gastro stromálních tumorů atd. k cílené biologické léčbě - Detekci cirkulující nádorové DNA a cirkulujících nádorových buněk - V rámci mezilaboratorní kontroly poskytujeme vzorky, vyšetření a zhodnocení vyšetření Ig detekce minimální reziduální/diseminované nemoci, vyšetření fúzních genů, mutační analýzu, cirkulující nádorové DNA a cirkulujících nádorových buněk ****************************************************************************************** * Know-how & technologie ****************************************************************************************** - Izolace a analýza nukleových kyselin z tkání a z buněk - Mikrodisekce z tkáňových řezů pro molekulární aplikace - Detekce klonálních přestaveb imunoglobulínů a T-buněčných receptorů - Detekce fúzních genů a hledání translokačních partnerů - Sekvenování první i druhé generace a detekce somatických mutací - Detekce minimální reziduální/diseminované nemoci - Izolace cirkulujících nádorových buněk a cirkulující nádorové DNA s následnou molekulárn ****************************************************************************************** * Členové týmu ****************************************************************************************** - prof. MUDr. Roman Kodet, CSc. - RNDr. Markéta Kalinová, Ph.D. - RNDr. Lenka Krsková, Ph.D. - RNDr. Jana Szabová, Ph.D. - Mgr. Markéta Charvátová - Mgr. Alena Kalfusová - MUDr. Linda Čapková, Ph.D. - prof. MUDr. Josef Zámečník, Ph.D. - prediktivní a referenční laboratoř České republiky ****************************************************************************************** * Projekty a spolupráce ****************************************************************************************** - Lymfomová skupina 2. LF UK a FN Motol – spolupráce s Kooperativní lymfomovou skupinou (K Lymphoma Study Group, CLSG). - Multioborové semináře (Tumor boards) - Laboratoř nádorové biologie 3. LF UK - Účast ve vědeckých projektech (GAUK, Výzkumné záměry, OPPK, VaVPI) ****************************************************************************************** * Přístrojové vybavení ****************************************************************************************** - MiSeq pro NGS - genetické analyzátory ABI 3130 a 3500 - Idylla Biocartis - Bioanalyzer 2100 - laserový mikrodisektor Palm MicroBeam - kapalinový chromatograf Wave - přístroje pro kvantitativní PCR (Cobas Z480, LighCyclery, IQcyclery) - laminární boxy - CO2 inkubátor atd. ****************************************************************************************** * Publikace ****************************************************************************************** - Lokvenc M, Kalinova M, Forsterova K, Klener P, Trneny M, Fronkova E, Kodet R.: Cyclin D1 molecular marker for minimal residual disease monitoring in patients with mantle cell lymp Hematol. 2017 Dec 22. - Krskova L, Stejskalova E, Kabickova E, Mrhalova M, Kodet R.: A t(4;19) pediatric undiffe with a novel variant of the CIC-DUX4 fusion transcript. Pathol Res Pract. 2017 Mar;213(3): - Kalfusova A, Krskova L, Kalinova M, Linke Z, Kodet R.: Gastrointestinal stromal tumors – detection of the Ki-67, TPX2, TOP2A, and hTERT telomerase subunit mRNA levels to determine activity and a potential for aggressive biological behavior. Neoplasma. 2016;63(3):484–92 - Kalinova M, Fronkova E, Klener P, Forsterova K, Lokvenc M, Mejstrikova E, Belada D, Moci M, Kodet R, Trka J.: The use of formalin-fixed, paraffin-embedded lymph node samples for t minimal residual disease in mantle cell lymphoma. Br J Haematol. 2015 Apr;169(1):145–8. - Krsková L, Mrhalová M, Kalinová M, Campr V, Capková L, Grega M, Háček J, Hornofová L, Ch Chmelová R, Kodetová D, Zámečník J, Kodet R.: Soft tissue tumors – the view of the molecul Cesk Patol. 2014 Jul;50(3):132–40. Review. - Kalinová M, Mrhalová M, Krsková L, Jungbauerová H, Kalfusová A, Manďáková P, Candová J, V, Kodet R.: A complex diagnostic approach in lymphomas: practical aspect in short case re Patol. 2014 Jul;50(3):118–26. - Kalinová M.: Minimal residual disease – detection possibilities in haematological and no malignancies. Cesk Patol. 2013 Oct;49(4):131-8. Review. - Krskova L, Augustinakova A, Drahokoupilova E, Sumerauer D, Mudry P, Kodet R.: Rhabdomyos analysis of Igf2, MyoD1 and Myogenin expression. Neoplasma. 2011;58(5):415–23 ****************************************************************************************** * Zajímá vás tato expertíza? ****************************************************************************************** Kontaktujte CPPT UK Web: www.cppt.cuni.cz/ [ URL "https://cppt.cuni.cz/"] Mail: transfer@cuni.cz Tel.: +420 224 491 255 *========================================================================================= * Naši experti a jejich pracoviště *========================================================================================= prof. MUDr. Roman Kodet, CSc. RNDr. Markéta Kalinová, Ph.D. Ústav patologie a molekulární medicíny 2. LF UK a FN Motol, Laboratoř molekulární patologi Web: https://www.lf2.cuni.cz/laborator-molekularni-patologie-lampa [ URL "https://www.lf2. laborator-molekularni-patologie-lampa"]