Laboratoř nádorové biologie ****************************************************************************************** * ****************************************************************************************** ****************************************************************************************** * Co nabízíme ****************************************************************************************** - Izolace nukleových kyselin z různých typů buněk, zmražených tkání či parafinových bločků - Analýza kvality nukleových kyselin - Stanovení relativní genové exprese a porovnání expresního profilu mezi požadovanými vzor vzorků - Příprava a zpracování expresních mikroarray experimentů - Detekce jednonukleotidových polymorfismů a mutací - Fluorescenční mikroskopie buněčných i tkáňových vzorků - Statistické zpracování výsledků - Interpretace výsledků - Konzultace designu experimentu a pomoc s výběrem vhodné metodiky pro studium dané otázky - Návrh postupu včetně časové a finanční rozvahy ****************************************************************************************** * Odborné zaměření ****************************************************************************************** - V laboratoři nádorové biologie studujeme nové prognostické a prediktivní znaky s potenci zlepšení léčby u pacientů s onkologickými onemocněními. - Hlavním modelovým typem nádoru je kolorektální karcinom, jedna z nejčastějších malignit rámci České republiky. - Jednotlivé projekty se zaměřují na stanovení expresní hladiny vybraných genů, studium zn s nádorovými kmenovými buňkami či na detekci a popis cirkulujících nádorových buněk v peri pacientů, včetně analýzy genomu individuálních buněk pomocí sekvenace druhé generace. ****************************************************************************************** * Členové týmu ****************************************************************************************** - Mgr. Pavel Pitule, Ph.D. – vedoucí laboratoře - Mgr. Pavel Ostašov, Ph.D. - Dipl.-Biol. Jana-Alleta Thiele - Eva Královcová - Ing. Petr Hošek - doc. RNDr. Martin Pešta, Ph.D. - MUDr. Ludmila Vodičková, CSc. - MUDr. Pavel Vodička, CSc. - Ing. Jiří Polívka - Dr. James Hicks ****************************************************************************************** * Vybrané publikace ****************************************************************************************** - Pitule P, Vycital O, Bruha J, Novak P, Hosek P, Treska V, Hlavata I, Soucek P, Kralickov Differential expression and prognostic role of selected genes in colorectal cancer patient Res. 2013 Nov; 33 (11): 4855–65. - Pitule P, Cedikova M, Daum O, Vojtisek J, Vycital O, Hosek P, Treska V, Hes O, Kralickov Immunohistochemical detection of cancer stem cell related markers CD44 and CD133 in metast cancer patients. Biomed Res Int. 2014; 2014: 432139. - Pitule P., Cedikova M., Treska V., Kralickova M., Liska V. Assessing colorectal cancer h step closer to tailored medicine. Journal of Applied Biomedicine. 2013 11 (3): 115–129. - Liska V, Vycital O, Daum O, Novak P, Treska V, Bruha J, Pitule P, Holubec L. Infiltratio carcinoma by S100+ dendritic cells and CD57+ lymphocytes as independent prognostic factors surgical treatment. Anticancer Res. 2012 May; 32 (5): 2129–32. - Hlavata I, Mohelnikova-Duchonova B, Vaclavikova R, Liska V, Pitule P, Novak P, Bruha J, Holubec L, Treska V, Vodicka P, Soucek P. The role of ABC transporters in progression and of colorectal cancer. Mutagenesis. 2012 Mar; 27 (2): 187–96. - Slyskova J, Cordero F, Pardini B, Korenkova V, Vymetalkova V, Bielik L, Vodickova L, Pit Matejka VM, Levy M, Buchler T, Kubista M, Naccarati A, Vodicka P. Post-treatment recovery repair capacity and gene expression levels in colorectal cancer patients. Mol Carcinog. 20 10.1002/mc.22141. ****************************************************************************************** * Zajímá vás tato expertíza? ****************************************************************************************** Kontaktujte CPPT UK Web: www.cppt.cuni.cz/ [ URL "https://cppt.cuni.cz/"] Mail: transfer@cuni.cz Tel.: +420 224 491 255 *========================================================================================= * Naši experti a jejich pracoviště *========================================================================================= Mgr. Pavel Pitule, Ph.D. Biomedicínské centrum Web: www.biomedic-plzen.cz [ URL "http://www.biomedic-plzen.cz"]